L'association pour la surveillance de la qualité de l'air AirPACA, dont le port de Marseille Fos est partenaire depuis 2004, a présenté le 19 mai 2017 un état de la qualité de l'air à Marseille (Bouches-du-Rhône). La contribution du transport maritime est comprise entre 5% et 10% selon les polluants.
Face à ce constat, le port de Marseille Fos a annoncé la mise en place dès le 1er juillet 2017 d'une prime qui doit inciter les armateurs à développer des performances environnementales supérieures aux exigences règlementaires. La prime sera accordée aux bateaux qui obtiennent un score supérieur à 35 sur l'indice Environmental Ship Index (1) (ESI). 236 navires pourraient en bénéficier en 2017, dont 60% de porte-conteneurs et 40% de paquebots de croisière. Le port de Marseille précise que le champ d'application pourra être étendu dès 2018 et que les exigences pourront être renforcées les années suivantes.
Parallèlement à la mise en place de cette prime, le port poursuivra son travail de recherche de solutions pour réduire les rejets des navires. Le branchement électrique à quai est désormais possible pour trois navires de la compagnie maritime La Méridionale qui desservent la Corse. Le port étudie la faisabilité du branchement à quai pour de nouveaux terminaux, en particulier pour la réparation navale. Il se penche également sur les conditions de mise en œuvre du soutage de gaz naturel liquéfié (GNL) et sur la pertinence technique et opérationnelle des épurateurs mobiles de fumées (scrubber mobile). Les résultats de ces études sont attendus pour l'automne 2017.