Jean-Michel Brun est ingénieur chimiste. Il entame sa carrière dans le secteur des déchets spéciaux avant de rejoindre GRS Valtech en 1995. Au sein de la filiale de SARP industries (Veolia), spécialiste des sites et sols pollués, il est chef d'agence, puis directeur général adjoint en 2000. A partir de 2006, Jean-Michel Brun est promu directeur général.
Il est également président de Bionor, centre de traitement biologique des terres polluées, rattaché à GRS Valtech. Il a rejoint le bureau de l'UPDS en 2009.