Jean-Marc Grognet est docteur en pharmacologie moléculaire, habilité à diriger les recherches. Il est également diplômé de l'Institut de l'administration des entreprises de la Sorbonne.
Il a passé l'essentiel de sa carrière au sein du Commissariat à l'énergie atomique (CEA). De 1985 à 2000, Jean-Marc Grognet est directeur du laboratoire d'études du métabolisme des médicaments et du groupe de pharmacologie clinique. De 2002 à 2007, il est directeur scientifique et directeur de recherche, spécialiste des biotechnologies.
En 2008, il est appelé au ministère de l'Economie et de l'Industrie au poste de sous-directeur en charge du secteur Industries de la santé, de la chimie et des nouveaux matériaux. Trois ans plus tard, il retourne au CEA et dirige l'Institut de biologie et de technologie de Saclay (Essonne) puis est nommé directeur de la valorisation en 2014.