Ingénieur général des ponts, des eaux et des forêts, Patrice Parisé a débuté sa carrière à la direction départementale de l'équipement de Seine-et-Marne. Il a occupé plusieurs postes au sein des ministères des transports, de l'équipement et de l'aménagement du territoire. Il a notamment été directeur général adjoint de l'établissement public d'aménagement de la ville nouvelle de Melun-Sénart (77) de 1985 à 1986, directeur chargé du financement, de la garantie et de la gestion des risques des contrats internationaux d'une des filiales du groupe Eiffage de 1986 à 1993 et directeur des programmes aéronautiques civils à la direction générale de l'aviation civile de 2001 à 2003.
En 2008, il est nommé à la tête de l'Institut géographique national (IGN) avant de prendre la présidence de la 5ème section (Sciences et techniques) du Conseil général de l'environnement et du développement durable (CGEDD) en 2012.