A 55 ans, le député Paul Giacobbi est à l'origine de la création de l'Office de l'environnement corse et de celle du Parc marin international des Bouches de Bonifacio, entre la Corse et la Sardaigne. Plus récemment, au printemps 2012, Paul Giacobbi, en sa qualité de président du Conseil exécutif de la Corse, a soutenu et obtenu l'adoption par l'Assemblée de Corse d'une analyse stratégique régionale ambitieuse en matière de création d'aires marines protégées sur l'île de beauté.
Il sera accompagné dans ses fonctions par Gérard Romiti, président du Comité national des pêches maritimes et des élevages marins (CNPEM), nouvellement élu et par le guadeloupéen Ferdy Louisy, président du Parc national de Guadeloupe.
Le conseil d'administration de l'Agence compte 16 représentants de l'État et 23 membres représentants les élus, les usagers et les associations.