A 44 ans, Frédéric Journès est agrégé de géographie, diplômé de l'Ecole supérieure de Commerce de Lyon et ancien élève de l'Ecole nationale d'administration. Il entame sa carrière au sein du ministère des Affaires Etrangères en 1998. Il est tout d'abord chargé de mission à la Direction des Français à l'étranger, puis il évolue vers la Direction politique du ministère en qualité de chargé de mission auprès du Directeur Politique.
A partir de 2003, il part pour New-York, où il intègre la Représentation permanente de la France à l'ONU en tant que Premier secrétaire en charge du désarmement et de la non-prolifération.
De 2007 à 2010, Frédéric Journès est Premier conseiller à l'Ambassade de France à Athènes et, en 2010-2011, il assure cette même responsabilité à l'Ambassade de France à Kaboul. En 2011, il devient Directeur adjoint des affaires stratégiques, de sécurité et du désarmement au Quai d'Orsay, avant d'intégrer en septembre 2013 le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives en tant que Directeur des relations internationales et Directeur du Pôle stratégie et relations extérieures.