Polytechnicien, Philippe Boucly est diplômé de l'Ecole des Mines de Paris. Il a passé l'ensemble de sa carrière dans le secteur gazier. Il débute en 1991 comme directeur de région de Gaz de France puis chargé de la coopération avec Gazprom en 1994. Cinq ans plus tard, il est élu président du directoire de Fragaz.
En 2002, il préside le directoire de SPP (Slovaquie) avant de rejoindre GRTgaz où il est directeur général de 2009 à 2013 puis conseiller spécial. Il était premier vice-président de l'Afhypac depuis 2013.