Tel est l'objectif poursuivi par une circulaire du ministère de l'Ecologie datée du 14 mai 2012. A l'occasion des 20 ans du réseau Natura 2000, il ressort effectivement que la France a pris du retard dans la mise en place des sites marins et dans le lancement des documents d'objectifs (Docob), qui constituent les plans de gestion de ces zones protégées.
Cette nouvelle circulaire complète celle du 19 octobre 2010 relative à la mise en place des comités de pilotage et aux Docob des sites Natura 2000 majoritairement marins. Elle prend en compte la création des conseils maritimes de façade (CMF) et le dispositif relatif aux plans d'action pour le milieu marin (PAMM) à l'échelle des sous-régions marines.
La circulaire expose également la contribution du réseau à l'objectif de la directive-cadre "stratégie pour le milieu marin" (DCSMM). De même que les modalités d'articulation entre, d'une part, les directives "habitats" et "oiseaux", et, d'autre part, la DCSMM.