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Carole Fonta est ingénieure en agro-alimentaire. Elle a entamé sa carrière en 1999 au sein du laboratoire d'analyses alimentaires et agricoles, In Vivo, en tant que coordinatrice qualité. Deux ans plus tard, elle rejoint le Syndicat des pâtes sèches (Sifpaf) au poste de chargée de mission Réglementation/qualité.

En 2004, elle est nommée responsable développement durable de l'association des entreprises de produits alimentaires élaborés (Adepale) puis secrétaire générale en 2008. Trois ans plus tard, elle prend en charge la direction développement durable de l'Association nationale des industries alimentaires (Ania).