L'eau de pluie n'est pas potable, car elle présente une contamination microbiologique et chimique supérieure aux limites de qualité retenues pour l'eau potable distribuée par le réseau public, explique l'organisme.
La DGS précise que l'usage de l'eau de pluie à l'intérieur des bâtiments implique la création d'un réseau spécifique de canalisations. Il faut donc être très attentif à la séparation de ces réseaux dès la conception et lors de travaux ultérieurs, ainsi qu'à leur signalisation visible et explicite.
La DGS avertit qu'en cas de connexion, le risque serait alors double: le risque qu'une personne puisse boire l'eau de pluie et, plus grave, que le réseau public d'eau potable soit contaminé par l'eau de pluie à l'occasion d'une chute de pression.
Afin de limiter ces risques, les usages intérieurs de l'eau de pluie sont limités à l'alimentation des chasses d'eau, au lavage des sols et, à titre expérimental et sous conditions, au lavage du linge.
La loi sur l'eau et les milieux aquatiques du 30 décembre 2006 a instauré un crédit d'impôts pour favoriser la récupération de l'eau de pluie. L'arrêté d'application paru le 21 août 2008 fixe les conditions de récupération et d'usage de l'eau de pluie provenant des toitures.