Diplômé de l'Institut national agronomique Paris-Grignon, ancien élève de l'Ecole nationale d'administration, Eric Allain est depuis décembre 2010 Directeur général des politiques agricole, agroalimentaire et des territoires. Il est également le commissaire général du gouvernement auprès des chambres d'agriculture.
Il avait précédemment occupé les fonctions de Chef du service de la forêt, de la ruralité et du cheval, adjoint du directeur général des politiques agricoles, agroalimentaires et des territoires de juillet 2008 à décembre 2010 au ministère de l'agriculture.
Il prendra ses nouvelles fonctions le 1er septembre.