Diplômé de l'Ecole supérieure de commerce de Paris et de l'Ecole des mines de Paris, Eric Mugnier a entamé sa carrière au service marketing de Air France avant de rejoindre Sita en 1994 en tant que technico-commercial en gestion de déchets.
En 1996, il intègre la société Arthur Andersen puis EY en 2002 pour développer les activités de conseil en environnement et développement durable. En parallèle de ses nouvelles fonctions de responsable du pôle Etudes environnement et développement durable d'EY, Eric Mugnier conserve son portefeuille clients auprès duqul il mène des missions d'audit et de conseil.