Par une note datée du 9 mai, la ministre de l'Environnement a adressé aux préfets de région de nouvelles instructions pour mettre en œuvre les plans nationaux d'action (PNA) en faveur des espèces de faune et de flore menacées.

Ces plans visent à mettre en place un suivi des populations, des actions coordonnées de restauration, une information des acteurs concernés et du public, ainsi qu'une intégration de la protection des espèces dans les activités humaines et les politiques publiques. Plus de 70 plans ont déjà été adoptés en faveur de plus de 200 espèces telles que le loup, le hamster commun ou le râle des genêts.

L'instruction fixe cinq lignes directrices pour l'élaboration et la mise en œuvre des plans, qui portent sur les éléments suivants : sélection des espèces prioritaires et détermination des priorités des plans, articulation et choix des outils de protection des espèces, choix du plan (rétablissement ou conservation) en fonction de l'objectif poursuivi, association des acteurs concernés, modalités de mise en place d'un PNA (structure, durée, animation, maîtres d'ouvrage, comité de pilotage, durée, bilan, etc.).

Cette instruction prend en compte les recommandations émises par le Conseil général de l'environnement et du développement durable (CGEDD) qui, en mars 2014, avait établi un bilan en demi-teinte du dispositif. Il prend également en compte les apports de la loi pour la reconquête de la biodiversité. Cette dernière impose l'élaboration avant le 1^er janvier 2020 de PNA en faveur des espèces endémiques identifiées comme étant "en danger critique" ou "en danger" par la liste rouge nationale établie selon les critères de l'Union internationale pour la conservation de la nature (UICN).