Laurent Roy est ingénieur général des ponts, des eaux et des forêts. Il a notamment été conseiller technique chargé de l'agriculture, de l'eau et de la mer auprès de Dominique Voynet, alors ministre de l'Environnement de 1997 à 2000. Laurent Roy a dirigé plusieurs directions régionales de l'environnement dont celle de Champagne-Ardenne. En 2009, il met en place la direction régionale de l'environnement, de l'aménagement et du logement (DREAL) de Provence-Alpes-Côte d'Azur, dont il sera le directeur jusqu'en 2012. A cette date, Laurent Roy prend en charge la direction de l'eau et de la biodiversité à la Direction générale de l'aménagement, du logement et de la nature au ministère de l'Ecologie.
Au sein de l'agence de l'eau, Laurent Roy aura notamment pour mission d'accompagner les collectivités dans la mise en œuvre de la nouvelle compétence de gestion des milieux aquatiques et de prévention des inondations (Gemapi), et de soutenir les projets pour préserver la qualité des captages d'eau potable, restaurer la continuité écologique des cours d'eau, et lutter contre les fuites.