Sophie Auconie a été députée européenne entre 2009 et 2014. Elle fait partie des membres fondateurs de l'Union des démocrates et indépendants (UDI) aux côtés de Jean-Louis Borloo, ancien ministre de l'Environnement.
Sophie Auconie est actuellement présidente du Cercle français de l'eau, vice-présidente du Comité national de l'eau. Elle est également gouverneure au Conseil mondial de l'eau. Au sein de ces organismes, Sophie Auconie milite pour l'accès à l'assainissement et pour une gestion durable et raisonnée des boues issues des stations d'épuration, rapporte le Club du retour à la terre.
A l'occasion de son élection à la tête du Club, elle a déclaré vouloir "apporter une valeur ajoutée en termes de communication et de pédagogie pour mettre en avant les expériences existantes, les démarches de valorisation des déchets organiques qui ont du sens".