Un décret, publié au Journal officiel du 23 avril 2022, institue un délégué interministériel chargé du suivi des conclusions du Varenne agricole de l'eau et de l'adaptation au changement climatique. Le poste, créé pour trois ans, est rattaché au ministre chargé de l'Environnement et au ministre chargé de l'Agriculture. Un second décret nommera le délégué, sur proposition des deux ministres.
Chargé du suivi de la mise en œuvre de la feuille de route issue des travaux du Varenne, le délégué interministériel doit assurer la coordination entre les actions de l'État et celles des services territoriaux. Il veille aussi « à la mise en œuvre rapide des actions prioritaires identifiées lors du Varenne pour optimiser et maîtriser la mobilisation des ressources en eau, cela dans le respect des équilibres naturels et des schémas directeurs d'aménagement et de gestion des eaux (Sdage) ». Il doit enfin « valoriser les travaux réalisés dans le cadre du Varenne », notamment concernant l'adaptation du secteur agricole aux conséquences des changements climatiques.
Le décret fixe cinq missions au délégué : garantir la continuité de la dynamique du Varenne et assurer son portage (il devient le référent sur la question agricole de l'eau) ; coordonner et promouvoir l'action des services de l'État en faveur d'une politique publique de l'eau en agriculture ; veiller à l'association de l'ensemble des acteurs concernés par la mise en œuvre de la feuille de route issue du Varenne ; « faire vivre les principes du Varenne », en s'appuyant, notamment, sur les instituts techniques et de recherches ; favoriser la mobilisation des ressources budgétaires.
Le délégué rendra régulièrement compte de ses actions aux deux ministres dont il dépend. En fin de mandat, il remettra un rapport Premier ministre pour faire le bilan de son action et formuler des propositions d'amélioration.