François Bourdillon, praticien hospitalier, est responsable du département de biostatistiques, de santé publique et d'information médicale du groupe hospitalier Pitié-Salpêtrière Charles Foix. Il est également chef du pôle santé publique, évaluation et produits de santé de l'établissement depuis 2011.
Il préside la commission prévention, éducation et promotion de la santé du Haut conseil de la santé publique (HCSP) et est membre du comité de pilotage de la Chaire santé de sciences Po.
Il a été président de plusieurs groupes de travail rattachés au ministère chargé de la santé et administrateur de l'Institut national de prévention et d'éducation pour la santé (Inpes).