Dans une communication publiée le 18 mai, la Commission a estimé qu'il valait mieux laisser aux Etats membres la marge de manœuvre nécessaire pour adapter au mieux la gestion de ces déchets aux conditions locales. Mais à l'instar du comité Environnement du Parlement, les eurodéputés jugent au contraire qu'un texte spécifique permettrait une plus grande clarté et un meilleur contrôle de la mise en oeuvre du traitement des biodéchets. Ils se sont prononcés pour une obligation de collecte et de recyclage des biodéchets afin de réaliser les objectifs fixés par la stratégie européenne d'ici 2020.
Ils ont réitéré à la Commission européenne de préparer une proposition de directive pour fin 2010, établissant une obligation de tri sélectif, sauf pour les cas où cette option n'est pas appropriée d'un point de vue environnemental et économique, un recyclage des biodéchets et une classification des différentes qualités de compost.