Cette communication de la Commission européenne constitue un document d'orientation non contraignant destiné à aider les États membres, les gestionnaires de sites et les autorités environnementales à adapter la gestion du réseau Natura 2000 aux effets du changement climatique, dans le respect des directives «Oiseaux» et «Habitats».

Le texte rappelle que le changement climatique représente une menace croissante pour la biodiversité européenne, dont le réchauffement progresse à un rythme sensiblement supérieur à la moyenne mondiale. Il souligne l'interdépendance entre crise climatique et crise de la biodiversité, et présente le réseau Natura 2000 — qui couvre des parts précisées du territoire terrestre et marin de l'UE — comme un outil central à la fois pour la conservation de la nature et pour la contribution aux objectifs d'atténuation et d'adaptation climatiques.

Le document précise comment les dispositions existantes des directives sur la nature peuvent être appliquées de manière flexible face aux impacts climatiques : adaptation des objectifs et mesures de conservation spécifiques aux sites, gestion des situations d'urgence (incendies, inondations), prise en compte des détériorations inévitables, ajustement éventuel des périmètres ou du statut juridique des sites. Il souligne que les États membres ne peuvent être tenus responsables de dégradations résultant de phénomènes climatiques inévitables, sous réserve que des efforts raisonnables d'adaptation aient été déployés.

Le texte développe un cadre d'adaptation en cinq étapes : préparation, évaluation des risques, identification et hiérarchisation des mesures, mise en œuvre et suivi. Il invite à recenser les habitats, espèces et sites les plus vulnérables, à évaluer la cohérence du réseau face aux évolutions climatiques attendues, et à renforcer la résilience des écosystèmes par des mesures de restauration, de connectivité et de gestion adaptative.

Enfin, le document met en avant les synergies possibles entre la conservation de Natura 2000 et des objectifs plus larges : séquestration et stockage du carbone, prévention des incendies de forêt, gestion des inondations, protection du littoral. Des études de cas illustrent ces approches dans plusieurs États membres. Le texte est accompagné d'annexes détaillant les changements climatiques observés et projetés, les impacts sur la biodiversité, le cadre d'adaptation et un catalogue de mesures potentielles.