Le 30 novembre 2007, Marion Guillou, Présidente de l'INRA, et François Patriat, Président du conseil régional de Bourgogne, en présence de Philippe Castanet, représentant du Préfet de la région de Bourgogne et Préfet de la Côte-d'Or, ont inauguré le Centre de Microbiologie du Sol et de l'Environnement (CMSE) sur le site de l'INRA de Dijon. A cette occasion l'INRA et le Conseil régional ont signé une convention bilatérale qui renforce leur partenariat existant depuis 1992.

Les recherches fondamentales et appliquées qui sont menées au sein du CMSE concernent la qualité de l'environnement et de la production agricole, l'émergence d'une agriculture fournissant de nouveaux services agro-écologiques et la préservation des ressources biologiques.
Un intérêt particulier est porté aux microorganismes bénéfiques du sol pouvant agir comme biofertilisants, biostimulants et bioprotecteurs des cultures, ou comme bioindicateurs de la qualité des sols (champignons mycorhizogènes, agents de lutte biologique des maladies, …), souligne l'INRA. Des bactéries dégradant les pesticides et d'autres molécules polluantes ou responsables de l'émission des gaz à effet de serre sont aussi au centre des préoccupations du CMSE, de même que la recherche d'inducteurs des mécanismes naturels de défense chez les végétaux.

L'enveloppe financière se monte à 10,35 M€, répartis entre le conseil régional de Bourgogne et l'INRA.