L'activité des ports de commerce interagit avec le milieu naturel marin, et notamment les sites classés au sein du réseau écologique européen "Natura 2000". Le CETMEF (Centre d'études techniques maritimes et fluviales), soutenu par le Ministère du développement durable, a souhaité sensibiliser les acteurs du secteur sur ce sujet. Le guide, Ports de commerce et Natura 2000 en mer, fournit un repère réglementaire et présente les catégories de pressions exercées sur les milieux et les espèces marines (oiseaux, poissons, mammifères).

Pratique et destiné à faire évoluer les comportements, cet outil permet de mesurer l'impact environnemental des activités portuaires. Objectif : entamer un suivi environnemental et lancer des mesures de réduction / suppression / compensation des activités néfastes pour l'écosystème marin.