Cette certification est plus précisément basée sur un référentiel organisé en plusieurs thèmes : management environnemental de l'opération, chantier propre, énergie et réduction de l'effet de serre, filière constructive et choix des matériaux, gestion économe de l'eau, confort et santé, gestes verts. Chaque thème regroupe une série de rubriques qui font l'objet d'une notation de 1 à 5 de la part de Cerqual, 5 représentant la meilleure note. Cerqual propose différents profils de notes éligibles à la certification « Habitat et Environnement ». Le constructeur choisi le profil qui l'intéresse en fonction des domaines sur lesquels il souhaite faire un effort. Mais dans tous les cas, les exigences des thèmes liés au management environnemental, à l'eau et aux gestes verts doivent être en totalité respectées.
La certification « Habitat et Environnement » propose depuis 2005 des options dites Haute Performance Energétique (HPE) et Très Haute Performance Energétique (THPE) représentant respectivement des besoins énergétiques inférieurs de 10% et de 20% à la réglementation thermique en vigueur soit la RT2005. Les projets de Bouygues Immobilier seront auto10% par rapport à l'actuelle RT2005.
Le processus initié sera effectif sur tous les permis de construire déposés à partir du 1er juillet 2007. D'ores et déjà trois programmes soit 149 logements ont été certifiés dont un à Magny-les-Hameaux dans les Yvelines (78). Un ensemble de 35 maisons bénéficient de la certification « Habitat et Environnement » grâce entre autres à l'installation de capteurs solaires assurant 30% des besoins énergétiques et à la création de ventilation par puits canadiens. 18 autres programmes totalisant 761 logements sont en cours de certification.
Si la certification « Habitat et Environnement » est réservée au logement neuf, la filiale Cerqual Patrimoine propose également une certification pour la rénovation et la réhabilitation de bâtiments de plus de dix ans. Dénommée Patrimoine Habitat & Environnement, cette certification est basée sur le même principe que celle des logements neufs. Elle permet de valoriser le programme de réhabilitation en fixant des niveaux de performance à atteindre sur un immeuble complet ou un ensemble de maisons individuelles groupées. Elle s'assure également que des dispositions managériales, d'organisation ou d'information ont été appliquées. À l'occasion du congrès de l'union sociale pour l'habitat qui s'est tenu en septembre dernier, Cerqual Patrimoine a annoncé que depuis le 1er janvier 2006, 3.600 logements ont été certifiés.